Valsaín se encuentra situado al sur de la provincia de Segovia, a 3 km del Real Sitio de La Granja de San Ildefonso y 14 km de la ciudad de Segovia. Desde Madrid se puede acceder por el puerto de Navacerrada M-601 (70 km/1hora) o bien por la autovía AP-6 y pasado el túnel de Guadarrama, por la AP-61 hasta enlazar con la carretera de circunvalación SG-20/N 110 siguiendo las indicaciones de La Granja. La Querencia de Valsaín se encuentra próxima al Centro Nacional de Educación Ambiental (CENEAM), allí donde comienzan los pinares de la Sierra de Guadarrama. Existe servicio de autobuses (www.lasepulvedana.es) desde Madrid y Segovia y la estación del AVE se encuentra a menos de 15 minutos (www.renfe.com).
Coordenadas GPS N 40º 52′ 26″ W 4º 01′ 16″